У 103-го нет такого режима - выхода OD с подтяжкой. У F030 - есть. Но внутренняя подтяжка около 50 кОм, а для нормальной работы I2C требуется в диапазоне 1,5 - 4,7 кОм
А вообще, лучше всего заглянуть в мануал:
Для конфигурации отладки в ./debugger/svd разместите svd файлы для вашего mcu и подправьте ./.vscode/launch.json (для openocd еще и ./debugger/openocd.cfg). Остальное (cmsis, startup's, и т.п.) размещайте как угодно - все через CMakeLists.txt указывается
project template.zip