Плюсы, если используем альтиум на двух и более рабочих местах. Например дома и на работе.
Проект (или библиотеки) закоммитили на работе, пришли домой, проапдейтили, и через 5 минут продолжаем работать с той же точки.
я использую именно так.
откаты на какие-то предыдущие версии и прочие фишки контролей версии не помню даже, чтоб понадобились.
сливы, конкатенации и т.д. с бинарными файлами в принципе невозможны.
----
если же работать на одном месте, лучше использовать бекап, причем автоматический.
я использую robocopy. можно поиском много инфы нарыть или могу свою инструкцию скинуть