Проблема решилась. оказалось все очень просто.
Линия CONF_DONE была хитро замкнута, толи через грязь на плате, то ли через волосок припоя, на землю.
Причем с приличным сопротивлением, но достаточным, что бы притянуть ее к 0.
Промывка, чистка, все привело в норму.
Спасибо всем за участие и советы.