А почему не выгружать скриптом, а отображать знакомым инструментом или своей программой на Qt?
Не придется своих велосипедов городить и не должно быть много ручной работы
При желании можно просто работать через tcl-скрипты, которые предоставляет Quartus, а графику реализовать на том же tk.
О скриптах можно почитать в Quartus II Scripting Reference Manual.
