Практически такая же фигня.
Собираю чужой проект с гитхаба. Собирал месяц назад в 1.9.9.01, собирается, но - не работает :((
Сегодня решил повторить подвиг, снова скачал гит, там есть собранный бинарник, заливаю его - работает! Собираю в IDE - не работает 😞 Хмм.. Сравниваю бинарники - в оригинале надпись, что собран в GOWIN Version: V1.9.8.11 Education
Собираю в этой Education - и собирается, и работает. Все. Занавес.