У меня аналогичная задача.
Не понятно, то есть Вы коммутируете ключами первичную подмагничивающую высоковольтную обмотку ? Если не затруднит, можно схему и почему 2 ключа?
Для разрывания цепи без учета напряжения достаточно было бы одного, а для смены полярности по идее нужен H-мост?
Какая модель и что у него с линейностью характеристики ?
Если нелинейная, чем калибровать?