Программатор читает не в режиме JTAG, у него свой алгоритм. Купил себе китайский XILINX DLC9LP и проверил на XC9572 TQ100, XC9536XL VGQ64, XC9572 PC44 читаеть checksum без ощибок и одинакова. Прочитав снова залил на все три микросхемы и первые две микросхемы нормально прошлись и одинаково у них checksum и верификацыя но XC9572 PC44 сделал верификацию и сравнение прошло без ощибок а при проверки checksum снова выдаёт не соответсвия суммы повторная верификацыя проходит без ощибок. Пробовал менять частоту но эффект тот-же. Может быть дело самой микросхеме?