rezident, по поводу остановки таймера при установке бита TACLR вы не правы - таймер сбрасывается и продолжает работать с нуля.
а по поводу DTC эффект сдвига действительно наблюдался. Однако до момента останова данные поападают на свои места (т.е. при первом останове они нормально расположены, а далее могут сдвигаться). Мне удавалось наблюдать нормальную работу, когда останов производился в обработчике прерывания АЦП.