[Kostochkin 0]

Здравствуйте. Меня зовут Василий.

Готов взяться за разработку fpga проектов различной сложности.

Имею опыт работы с FPGA xilinx spartan 6, artix 7, kintex 7, altera  max 10, cyclone 4, 5.

ПО - ISE, vivado, quartus, active-hdl, modelsim.

Интерфейсы - ethernet, ip/tcp/udp, spi, i2c, uart, can, modbus, sram, emmc, гигабитные трансиверы.

Есть опыт в области обработки изображений.

Моделирование, верификация, отладка.

Район - Москва и область. Работа удаленная или частично удаленная, готов иногда приезжать в офис, если он в транспортной доступности.

Благодарю.

Изменено 17 октября, 2019 пользователем Kostochkin

[Kostochkin 0]

Моя почта - [email protected].

[genseq 0]

Здравствуйте, Василий.

Есть желание разработать нанопоровый секвенатор. Скромный по параметрам, но работоспособный. Проблема в том, что я в электронике не разбираюсь. Правда, там и без электроники проблем хватает. В простейшем виде задача (для электронщиков) сводится к считыванию сигналов (пикоамперных токов) с массива нанопор в рабочей ячейке. Если ориентироваться на уже готовые ячейки (Flongle), то это площадка из 10х13 контактов с шагом 1,27 мм. Из них 126 контактов подведены к сенсорным лункам, а остальные (4) - к общему внешнему электроду. Общее описание задачи есть здесь: https://habr.com/ru/post/455156/ 

Сейчас нужно грамотно сформулировать задачу для разработчиков монопорового секвенатора - с массивом из 126 сенсоров, подключаемых к одному (или нескольким)усилителям фемто- или пикоамперных токов. При этом лучше всего ориентироваться на подключение готовых (Flongle) ячеек к готовым одноканальным (или малоканальным) усилителям. Как к уже устаревшим, так и к новейшим, типа Pico (1 канал), PocketBatch (16 каналов) и т.п.: http://www.tecella.com/

Если не ошибаюсь, для мультиплексирования каналов могут подойти FPGA, имеющие более 100 входных и несколько десятков выходных контактов. И на выходе придётся ставить чопперные усилители, поскольку чувствительности того же Pico (с рабочими диапазонами 2 или 20 наноампер) будет недостаточно.

Предусилители можно ставить и на каждом канале (см. работу бразильцев), но это выглядит несколько громоздко.

Для начала хотелось бы грамотно сформулировать задание (и/или ТЗ). И найти людей, способных справиться с этой задачей. На сам проект у меня денег нет, но готов стимулировать его обсуждение на этом форуме. Если согласитесь затеять здесь  обсуждение данного проекта, то моя благодарность не будет иметь границ (в пределах разумного). Сам я для таких целей слишком безграмотен (из биологов!). 

MAE_fambrini2017.pdf

[Kostochkin 0]

On 10/22/2019 at 7:56 PM, genseq said:

Здравствуйте, Василий.

Есть желание разработать нанопоровый секвенатор. Скромный по параметрам, но работоспособный. Проблема в том, что я в электронике не разбираюсь. Правда, там и без электроники проблем хватает. В простейшем виде задача (для электронщиков) сводится к считыванию сигналов (пикоамперных токов) с массива нанопор в рабочей ячейке. Если ориентироваться на уже готовые ячейки (Flongle), то это площадка из 10х13 контактов с шагом 1,27 мм. Из них 126 контактов подведены к сенсорным лункам, а остальные (4) - к общему внешнему электроду. Общее описание задачи есть здесь: https://habr.com/ru/post/455156/ 

Сейчас нужно грамотно сформулировать задачу для разработчиков монопорового секвенатора - с массивом из 126 сенсоров, подключаемых к одному (или нескольким)усилителям фемто- или пикоамперных токов. При этом лучше всего ориентироваться на подключение готовых (Flongle) ячеек к готовым одноканальным (или малоканальным) усилителям. Как к уже устаревшим, так и к новейшим, типа Pico (1 канал), PocketBatch (16 каналов) и т.п.: http://www.tecella.com/

Если не ошибаюсь, для мультиплексирования каналов могут подойти FPGA, имеющие более 100 входных и несколько десятков выходных контактов. И на выходе придётся ставить чопперные усилители, поскольку чувствительности того же Pico (с рабочими диапазонами 2 или 20 наноампер) будет недостаточно.

Предусилители можно ставить и на каждом канале (см. работу бразильцев), но это выглядит несколько громоздко.

Для начала хотелось бы грамотно сформулировать задание (и/или ТЗ). И найти людей, способных справиться с этой задачей. На сам проект у меня денег нет, но готов стимулировать его обсуждение на этом форуме. Если согласитесь затеять здесь  обсуждение данного проекта, то моя благодарность не будет иметь границ (в пределах разумного). Сам я для таких целей слишком безграмотен (из биологов!). 

MAE_fambrini2017.pdf

Здравствуйте.

Я могу попробовать развить эту тему,

но вам, как я понял в первую очередь нужен схемотехник, к которым я не отношусь, я - программист FPGA.

Благодарю.

[Kostochkin 0]

Актуально, также готов работать с lattice.