ext2 использует дефрагментатор e2defrag.
ext3: e2defrag может работать с ext3, только если её временно преобразовать в ext2. Вместо этого можно использовать дефрагментатор, не зависящий от файловой системы — например, Shake.[8]
ext4: e4defrag, работающий за счет создания экстентов и перемещения в них файлов.
ЗЫ. Дефрагментация нужна на любой ФС и любом диске, ибо фрагментация - это суровая правда жизни для любой ФС, что касается SSD, то в виду очень малого времени "позиционирования" ее эффект снижается, и самое главное, при этом резко растет износ флеш памяти.
Про автодефрагментаторы, да, они вроде, как заменяют обычные программы, но любая подобная фишка добавляет тормоза при работе с ФС.
