1. При подключении к USB голого (неподключенного к таргету) прогера с непрошитой мегой должен 6 раз в течение 5 сек. отморгать светодиод.
2. После прошивки меги в прогере, при подключении прогера к USB светодиод должен трижды моргнуть в течение 1 сек. и погаснуть. При дальнейшем подключениии таргета, светодиод должен загореться и гаснуть только после отключения таргета.
3. Прошитый голый прогер в терминале после двукратного нажатия ввода должен просить ввести версию и т.д.

Если необходимо поменять порты на меге прогера:
скачиваете и устанавливаете winavr.
скачиваете последнюю версию исходников.

в файле "analog.h" меняете #define RESETADC на номер АЦП к которому подключен делитель с ресета.
в файле "led.h" букву порта и номер пина, куда подключен светодиод.
в файле "spi.h" аналогичным образом настраиваете куда подключены сигналы "TG_SCK", "TG_MISO", "TG_RESET" и "TG_MOSI".
в файле "makefile" прописываете свой чип и свой кварц.
потом в каталоге с исходниками запускаете через консоль "make".

получаете прошивку.